El centro asistencial tiene 16 años desde que se dio inicio a su construcción, pero continúa sin completarse a pesar de que se han realizado pagos, equivalentes al 90% del costo total de la obra y la construcción solo tiene un avance del 38%.
La Comisión Presidencial contra la Corrupción y autoridades de los Ministerios de Salud y Comunicaciones presentaron una denuncia ante el incumplimiento en el último contrato para la construcción y equipamiento del Hospital de San Pedro Necta, Huehuetenango.