La espera para definir cómo se desarrollará el Torneo Clausura 2025 ha terminado, tras concluir la Asamblea General Extraordinaria de la Liga Nacional, se aprobó el cambio de formato para este torneo, confirmando el descenso del Deportivo Zacapa y dejando 11 competidores por el título de campeón. El formato regresa a enfrentarse “todos contra todos” en 22 jornadas, en las que se jugará un partido de local y otro de visita contra cada equipo, dejando una jornada de descanso para cada equipo en la que se hubiera enfrentado al ahora descendido.
Las jornadas de la primera vuelta se definieron a través de un sorteo y quedaron de la siguiente manera:
Primera Jornada, 18 Y 19 de enero
- Antigua GFC – Guastatoya
- Cobán Imperial – Malacateco
- Marquense – Xinabajul
- Comunicaciones – Mixco
- Achuapa – Xelajú MC
- Municipal (Descansa)
Segunda Jornada, 22 y 23 de enero
- Mixco – Marquense
- Xinabajul – Cobán Imperial
- Xelajú MC – Antigua GFC
- Guastatoya – Comunicaciones
- Municipal – Achuapa
- Malacateco (Descansa)
Tercera Jornada, 25 y 26 de enero
- Cobán Imperial – Mixco
- Xelajú MC – Municipal
- Marquense – Guastatoya
- Comunicaciones – Antigua GFC
- Achuapa – Malacateco
- Xinabajul (Descansa)
Cuarta Jornada, 29 y 30 de enero
- Antigua GFC – Municipal
- Xinabajul – Achuapa
- Comunicaciones – Marquense
- Malacateco – Xelajú MC
- Guastatoya – Cobán Imperial
- Mixco (Descansa)
Quinta Jornada, 1 y 2 de febrero
- Cobán Imperial – Comunicaciones
- Xelajú MC – Xinabajul
- Marquense – Antigua
- Achuapa – Mixco
- Municipal – Malacateco
- Guastatoya (Descansa)
Sexta Jornada, 5 y 6 de febrero
- Antigua GFC – Malacateco
- Mixco – Xelajú MC
- Xinabajul – Municipal
- Marquense – Cobán Imperial
- Guastatoya – Achuapa
- Comunicaciones (Descansa)
Séptima Jornada, 8 y 9 de febrero
- Cobán Imperial – Antigua GFC
- Xelajú MC – Guastatoya
- Achuapa – Comunicaciones
- Malacateco – Xinabajul
- Municipal – Mixco
- Marquense (Descansa)
Octava Jornada, 12 y 13 de febrero
- Antigua GFC – Xinabajul
- Mixco – Malacateco
- Marquense – Achuapa
- Comunicaciones – Xelajú MC
- Guastatoya – Municipal
- Cobán Imperial (Descansa)
Novena Jornada, 15 y 16 de febrero
- Xinabajul – Mixco
- Xelajú MC – Marquense
- Achuapa, Cobán Imperial
- Malacateco – Guastatoya
- Municipal – Comunicaciones
- Antigua GFC (Descansa)
Décima Jornada, 22 y 23 de febrero
- Mixco – Guastatoya
- Xinabajul – Comunicaciones
- Achuapa – Antigua GFC
- Malacateco – Marquense
- Municipal – Cobán Imperial
- Xelajú MC (Descansa)
Las siguientes once jornadas de la segunda vuelta serán de la misma manera, cambiando la condición de local por visita y viceversa, finalizando el 23 o 24 de abril.
Los ocho equipos que clasifiquen a los cuartos de final, iniciarán la competición el 26 o 27 de abril, jugando en una semana la ida y vuelta, asimismo para las semifinales y la final se jugará la ida y vuelta con una semana de diferencia, culminando el 18 de mayo de 2025.